У одной нашей знакомой малышки с глазами была похожая, на мой взгляд, история. Потом ей назначили оклюдор и он ей помог научиться фокусироваться на предметах разными глазами. То есть один глаз у нее закрыт, другим она видит. Но двумя сразу у нее пока так и не получается (ей уже 4 года). Хотя у вас может быть что-то другое.
Удачи в лечении вашему малышу!!!